关于stem cell marker的筛选的设想

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发信人: zhaohu (天外飞猪), 信区: Biology
标  题: 关于stem cell marker的筛选的设想
发信站: BBS 未名空间站 (Tue Nov 18 16:54:41 2014, 美东)

几年前基于inducible Cre的lineage tracing技术的出现对stem cell的研究是关键的
。但并没有很多stem cell 的 in vivo marker被identified出来。比如说liver
tissue,都知道其可以再生，但是它有没有stem cell仍然在争议。更莫提marker了。
endothelium是个快速turn
over的组织，但起在成体内stem cell population的identification仍然未知。

筛选stem cell marker的方式可以有两个途径
第一就是正向的从已知marker出发，比如说通过已知marker筛选出某stem cell
population, 分析其有啥gene 高表达，以此出发建立CreERT transgenic model来确认
新的marker.
对stem cell来说找到marker不是目的，更重要的是这个maker背后的mechanism. 一个
新的marker市时常可以揭示新的regulation mechanism.
第二个途径是逆向寻找，说来就有些盲目了。就是我说的直接筛选那些available Cre
ERT mouse strains.比如那些Brainmap project建立起来上百个CreERT strain based
on enhancer trap. 本意是研究大脑的gene expression map.但也许这些老鼠也会在别
的组织有意外的惊喜呢。 这个真的纯粹靠运气了，而且得看全身各个组织而不是局限
于某个特定器官。我自己做了5，6个strain的检查，有俩个strain有意外发现，一个叫
ETV1的 creERT，意外的发现其在成体的salivary gland有非常特异的表达，文献没有
报道过。 另外一个是在成体的静脉，淋巴endothelium有极其特异的表达。没有任何文
献研究过这个gene.
这就是我很喜欢做这种盲目筛选的原因，每次拿去荧光显微镜下看得时候都会很激动和
期盼，谁知道会有啥意外发现呢。 这些老鼠也不贵，JAX里在cryopreserve前一个
strain才不到300元。